本发明提供了一种精制棉污泥的处理方法，属于废固体废弃物无害化处理和循环利用技术领域。本发明精制棉污泥的处理方法包括：将复合菌剂与由精制棉污泥、绿狐尾藻、牛粪和稻草组成的混合物料混匀，得到堆肥堆体，依次进行一次发酵、二次发酵；所述复合菌剂包括枯草芽孢杆菌菌液、地衣芽孢杆菌菌液、酿酒酵母菌液和绿色木霉孢子悬浮液。本发明所述复合菌剂可使堆体快速升温、腐熟彻底、生产周期短，得到的有机肥可提高果蔬的品质和产量。实验结果表明，与处理1和处理2相比，施用本发明提供的有机肥，平均株高可分别提高2.3cm、1.5cm，平均亩产量分别增加333.5kg、166.75kg；增产率分别为18.52％、8.47％。