本发明公开了一种在重金属污染土壤上种植亚麻的方法，其步骤：A．整地建园，施用钝化剂，降低土壤重金属的活性；B．选用耐重金属污染能力强的亚麻特定品种，足量适时播种，确保一播全苗；C．合理密植，及时中耕／除草／追肥，培育有效壮株；D．强化病虫害防治，适时采收，妥善晒储。应用本方法种植亚麻，轻度、中度、重度污染土壤的原茎平均产量分别为308.2 ± 29.0、283.2 ± 30.3与254.7 ± 28.6千克/亩，均达到了我国南方亚麻产区的高产水平，且原茎粗纤维中的重金属含量可控制在相关标准限值的范围内，实现了重金属污染土壤的农业安全与高效利用，技术简便、方法易行，在广大重金属污染地区的应用前景极其广阔。