本发明公开一种稻田表层土壤净碳储量的估算方法，涉及全球气候变化相关领域中稻田碳储量估算，估算的对象为稻田表层土壤净土壤碳储量变化，所要解决的是稻田表层土壤由容重变化所引起的表层土壤碳储量估算误差的校正技术问题。该估算方法首先确定表层土壤的基准统计厚度及实验前后该厚度内土壤有机碳含量、容重等数据，根据实验前后质量守恒原理，建立公式计算该基准统计厚度内土壤质量变化值，再将试验前后土壤容重数据进行比较，来确定表层土壤碳储量校正公式。该方法具有高效、简单、易于应用等特点，可广泛应用于对全球气候变化中稻田表层土壤净碳储量估算领域。本发明进一步涉及实现该方法的技术。